Univerzita Karlova se zaměřuje nejen na financování přes Fond pro podporu strategických partnerství. Zaměřuje se také na společně financované projekty, například v rámci sítě CENTRAL a společného počátečního financování s Univerzitou St Andrews, stejně tak na užší spolupráci s University of Sussex. Cílem těchto aktivit je posílit přeshraniční spolupráci ve výzkumu, umožnit společné projekty, publikace a akce, vytvořit nové výzkumné týmy, podporovat začínající vědce a vytvořit prostředí příznivé pro akademickou kariéru.
